====== Uso de dados do Repositório Figshare ======

O Figshare é um repositório online que contém dados de pesquisas publicadas em periódicos. É um plataforma aberta, que permite o acesso ao banco de dados e planilhas utilizados em artigos. No entanto, é necessário verificar quais dados e como estão disponibilizados. No caso de artigos voltados para qualidade do leite e mastite em vacas leiteiras, alguns repositórios apresentaram dados de tabelas já processados, como por exemplo médias, medianas, desvio padrão, etc. Nesse caso, não é possível aplicar quaisquer tipo de análise. Portanto, considerando o conceito de open science, dados já manipulados não podem ser utilizados. 

O artigo escolhido foi [[https://bmcvetres.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12917-016-0905-3|Bovine mastitis: prevalence, risk factors and isolation of Staphylococcus aureus in dairy herds at Hawassa milk shed, South Ethiopia]]. Um exemplo do dataset bruto:

{{ :opensci:2024:thati:dataset_hawassa_2024-04-17_at_2.26.34 pm.png?600 |}}

A mastite é uma inflamação da glândula mamária em vacas leiteiras, geralmente ocorrendo em vacas de alta produção. Essa inflamação pode ser causada por choques mecânicos, mas cerca de 80% dos casos de mastite são causados por patógenos, em sua maioria bactérias [[https://edisciplinas.usp.br/pluginfile.php/5746251/mod_resource/content/1/Gonçalves%20et%20al.,%202018%20-%20Bovine%20subclinical%20mastitis%20reduces%20milk%20yield%20and%20economic%20return%20-%20doi.org10.1016j.livsci.2018.01.016.pdf|(Gonçalves et al., 2018)]]. No artigo escolhido, os autores tiveram como objetivo identificar os fatores de risco envolvidos na mastite bovina causada por //Staphylococcus aureus//, uma bactéria de grande importância na mastite bovina principalmente pelo seu comportamento contagioso e de difícil controle. Essa espécie possui capacidade de formação de cistos na glândula mamária, dificultando a ação de antimicrobianos intramamários e garantindo a sobrevivência da bactéria [[https://www.vet.cornell.edu/animal-health-diagnostic-center/testing/protocols/staph-aureus-herd-infection-control#:~:text=Mastitis%20caused%20by%20Staph%20aureus,the%20likelihood%20of%20treatment%20cure.|(Cornell University, 2024)]]. Essa característica confere à espécie a capacidade de sobrevivência e possível adaptação aos antimicrobianos, surgindo assim a resistência aos antimicrobianos/superbactérias, um problema de saúde pública. Assim, entender os fatores de risco envolvidos na mastite bovina causada por //S. aureus// é uma forma eficaz e preventiva para evitar o contágio dessa bactéria entre animais sadios e doentes durante a ordenha.

===== Análise Exploratória dos Dados =====

O dataset contém variáveis como id da vaca, código da fazenda, tipo de sistema de produção, sistema de alojamento, tipo de cama, características de limpeza de úbere (tipo de limpeza e secagem), quantidade de vacas em lactação, raça, estágio de lactação, idade, produção de leite, frequência de ordenha, histórico de mastite, resultado microbiológico, entre outras.

Abaixo, uma visualização da estrutura dos dados: 

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