opensci:2022:trab1
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| + | Environmental Science ([[opensci: | ||
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| + | ===== Open Forestry ===== | ||
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| + | <font size=" | ||
| + | <p style=" | ||
| + | LIMA, R.A.F et al. Making forest data fair and open. Nature Ecology & Evolution, p. 1-3, 2022. | ||
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| + | <hr/> | ||
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| + | Redação: [[opensci: | ||
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| + | ====== Ferramentas ====== | ||
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| + | O movimento de ciência aberta defende artigos de acesso livre, dados de pesquisa compartilhados, | ||
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| + | Tais habilidades certamente facilitarão a criação de conhecimento mais eficiente e podem até abrir novos rumos de pesquisa. A ciência aberta permite diversos usos de artigos e ferramentas de pesquisas integradas para a elaboração de projetos públicos oriundos do //open science//, além disso, seguir os princípios para que este trabalho seja [[https:// | ||
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| + | Aqui estão alguns repositórios de dados sem fins lucrativos que cumprem os princípios FAIR: | ||
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| + | [[https:// | ||
| + | Hospedado pela Harvard University, este repositório de dados oferece armazenamento gratuito de dados de pesquisa. Como todos os serviços desta lista, ele atribuirá um Identificador de Objeto Digital aos seus dados para garantir que sejam creditados a você. | ||
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| + | [[https:// | ||
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| + | De propriedade da Microsoft, o GitHub tornou-se o repositório de dados padrão para codificadores. 500 MB de espaço público privado e ilimitado são oferecidos gratuitamente. | ||
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| + | [[https:// | ||
| + | Plataforma aberta para obtenção de informações geográficas de malhas urbanas espalhadas pelo mundo, com atribuições específicas sobre o ambiente em questão. | ||
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| + | [[https:// | ||
| + | Plataforma de ornitólogos que realizam ciência cidadã para a obtenção de diversidade de espécies de aves em todo o perímetro florestal e urbano do mundo. | ||
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| + | [[https:// | ||
| + | O mecanismo de busca acadêmico também oferece estatísticas de desempenho dos usuários que criaram um perfil. | ||
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| + | [[https:// | ||
| + | Mostra todos os tipos de estatísticas, | ||
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| + | [[https:// | ||
| + | Originalmente desenvolvido para rastrear revisões por pares, mas agora oferece uma variedade de estatísticas de desempenho do pesquisador. Propriedade da Clarivate. | ||
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| + | [[https:// | ||
| + | ORCID significa Open Researcher and Contributor Identifier. A organização sem fins lucrativos por trás do ORCID decidiu vincular inequivocamente um pesquisador à sua pesquisa. Além de uma lista de publicações, | ||
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| + | Além disso, existem linguagens de programação gratuitas que permitem a manutenção e análise dos dados obtidos através das plataformas open science para a elaboração de produtos que ofereçam o mesmo serviço integrado e aberto para a população, | ||
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| + | O vídeo a seguir comenta sobre algumas ferramentas para que a pesquisa seja aberta e reproduzível: | ||
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| + | {{youtube> | ||
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| + | A ciência aberta ainda enfrenta muitos problemas, incluindo classificação, | ||
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| + | ====== Tendências ====== | ||
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| + | Entendendo a necessidade democrática da implementação de práticas de Governos Aberto, o Brasil lançou em 2018 o [[https:// | ||
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| + | - Implantação de uma rede interinstitucional pela Ciência Aberta | ||
| + | - Realização de diagnóstico nacional e internacional da Ciência Aberta | ||
| + | - Definição de diretrizes e princípios para políticas institucionais de apoio à Ciência Aberta | ||
| + | - Promoção de ações de sensibilização, | ||
| + | - Articulação com agências de fomento para a implantação de ações de apoio à Ciência Aberta | ||
| + | - Articulação com editores científicos para a implantação de ações em apoio à Ciência Aberta | ||
| + | - Implantação de infraestrutura federada piloto de repositórios de dados de pesquisa | ||
| + | - Proposição de padrões de interoperabilidade para repositórios de dados de pesquisa | ||
| + | - Proposição de conjunto de indicadores para aferição da maturidade em Ciência Aberta | ||
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| + | Neste contexto, apresenta-se como tendência no país a adoção da ciência aberta como modus operandi das principais universidades e agências de fomento à pesquisa. Baseada na [[https:// | ||
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| + | Por fim, a nível internacional, | ||
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| + | ---- | ||
| + | **Podcast USP Analisa - Open Science** | ||
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| + | Open Science ou Ciência Aberta é um movimento mundial que busca tornar dados resultantes de pesquisas científicas mais acessíveis dentro e fora da comunidade acadêmica. | ||
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| + | * Mas que impactos isso pode trazer a produção científica? | ||
| + | * Como a Universidade está se preparando para essa tendência? | ||
| + | {{youtube> | ||
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| + | ====== Tidyverse====== | ||
| + | ==Por: Evandro Magalhães, Guilherme Landim e Jorge Monteiro== | ||
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| + | “Conjuntos de dados Tidy são todos iguais, mas todo conjunto de dados bagunçados são únicamente bagunçados.” –– Hadley Wickham | ||
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| + | {{ : | ||
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| + | ==== O que é a filosofia Tidy?==== | ||
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| + | <p align=" | ||
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| + | Os princípios para a elaboração de dados limpos através de uma interface uniforme permite a dominação de um pacote que pode ser interligado à lógica | ||
| + | de outro. O tidyverse parte de uma base “crua” e a transformam até obter uma base de dados analítica, que, a menos de transformações simples, está preparada para | ||
| + | gerar tabelas e gráficos e alimentar modelos. O Tidyverse é um conjunto de pacotes para ciência de dados que possuem gramática, estrutura de dados e principalmente, | ||
| + | uma filosofia em comum. A filosofia é de trabalhar sempre com dados tidy (arrumados) e ter todas as ferramentas para transformar os dados que tivermos em tidy. | ||
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| + | O tidyverse segue os seguintes princípios para uma [[https:// | ||
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| + | ===Reutilizar estruturas de dados existentes=== | ||
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| + | <p align=" | ||
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| + | Quando possível, é melhor utilizar estruturas de dados comuns do que criar uma estrutura específica para o seu pacote. | ||
| + | Geralmente, é melhor reutilizar uma estrutura existente mesmo que ela não se encaixe perfeitamente. | ||
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| + | ===Organizar funções simples usando o pipe=== | ||
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| + | <p align=" | ||
| + | O pipe, %>%, é uma ferramenta de composição comum que funciona em todos os pacotes. Faça com que suas funções sejam o mais simples possíveis. Com o pipe é possível programar de forma mais compacta, legível e correta. Uma função deve poder ser descrita com apenas uma sentença. | ||
| + | A sua função deve fazer uma transformação no estilo copy-on-modify ou ter um efeito colateral. Nunca os dois. | ||
| + | O nome das funções devem ser verbos. Exceto quando as funções do pacote usam sempre o mesmo verbo. Ex: adicionar ou modificar. | ||
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| + | ===Programação Funcional=== | ||
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| + | <p align=" | ||
| + | O tidyverse trata de um conjunto de pacotes lógicos que combina a manipulação de vetores para a visualização de dados em mapas para gerar uma comunicação sobre | ||
| + | o fenômeno que o ocorre com a combinação dos fatores que aqueles dados possuem. | ||
| + | Esta manipulação combinada é dado pela exploração algébrica dos conjuntos numéricos para a formação de equações que possam entender as variáveis ajustadas de acordo | ||
| + | com a lista de dados que foi obtida através da dinâmica do processamento do código. | ||
| + | A visualização combinada destes dados é ralizado por visulizações geométricas em diferentes escalas de acordo com a equação lógica atribuida, informando a posição dos vetores | ||
| + | distribuidos de acordo com a matemática atribuída para o entendimento do fenômeno a ser explorado. | ||
| + | Cada pacote do tidyverse lida com um diferente tipo de lógica. | ||
| + | </ | ||
| + | ===Projetado para ser usado por seres humanos=== | ||
| + | < | ||
| + | <p align=" | ||
| + | Desenvolva o seu pacote para ser usado por humanos. Foque em ter uma API clara para que você escreva o código de maneira intuitiva e rápida. | ||
| + | Eficiência dos algoritmos é uma preocupação secundária, | ||
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| + | Em resumo, toda variável está em uma coluna, e toda coluna é uma variável! | ||
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| + | ==== Quais são as regras para ser Tidy?==== | ||
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| + | O padrão a ser seguido para a criação de dados e tabelas Tidy são em essência simples: | ||
| + | - Cada variável é uma coluna | ||
| + | - Cada observação é uma linha | ||
| + | - Cada tipo de unidade observacional é uma tabela | ||
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| + | <p align=" | ||
| + | Neste contexto, dados que não obedeçam esse conjunto de regras são considerados bagunçados (messy data). | ||
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| + | De acordo com [[http:// | ||
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| + | - Os cabeçalhos são valores, não o nome das variáveis; | ||
| + | - Multiplas variáveis estão armazenadas na mesma coluna; | ||
| + | - Variáveis armazenadas tanto em linhas, como em colunas; | ||
| + | - Diferentes tipos de unidades observacionais estão armazenadas na mesma tabela; | ||
| + | - Uma única unidade observacional está armazenada em diferentes tabelas. | ||
| + | |||
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| + | ==== O que é tidyverse? | ||
| + | < | ||
| + | <p align=" | ||
| + | O Tidyverse é uma coletânea de pacotes que podem facilmente ser instaladas pelo aglomerador de pacotes chamado '' | ||
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| + | ==== Pacotes do Tidyverse==== | ||
| + | < | ||
| + | <p align=" | ||
| + | No dia a dia cheio de análises de uma cientista de dados, provavelmente ela utilizará um dos pacotes do universo Tidy. Estes são: | ||
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